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Mónica Chagoyen Quiles
PhD, jefa del departamento de Análisis de secuencias en Biología de Sistemas del CNB.
¿Qué ha estudiado?
Es ingeniera de telecomunicaciones y realizó el doctorado en el campo de la ingeniería informática y de telecomunicaciones.
¿Por qué aprendió R?
Lo aprendió de forma autodidacta después de realizar su tesis doctoral.
¿Le ha ayudado a encontrar su trabajo actual?
No
¿Para qué usa R?
Principalmente para el análisis de datos. A partir de ahí se puede realizar un nuevo modelo computacional con una aplicación web, como es el ejemplo de las plataformas MBROLE y BaFF (junto con Javier López-Ibáñez)
http://csbg.cnb.csic.es/mbrole2/
(VER ENTREVISTA 2)
Actualmente trabaja en el área de la transcriptómica. Estudia los genes determinadas etapas de cada tipo celular durante el desarrollo embrionario para determinar si las enfermedades genéticas tienen una expresión diferencial.
¿Qué ventajas tiene R?
Es un lenguaje muy específico con librerías muy extensas, y menos intuitivo que otros lenguajes como Python. Las distintas aplicaciones web creadas son muy útiles para la comunidad científica.
¿Qué futuro le ve a R? ¿Es importante que los estudiantes de Biotecnología programen en este lenguaje?
Cada vez los estudiantes vienen más preparados en este lenguaje, por lo que tendrá futuro, siendo fundamental en el análisis de datos. R es muy versátil.
Javier López-Ibáñez
Ph.D.Student, Computational Systems Biology Group, CNB-CSIC
¿Qué ha estudiado?
Graduado en bioquímica; actualmente está realizando su tesis doctoral sobre el análisis de datos de las rutas metabólicas de compuestos químicos.
¿Por qué aprendió R?
Cursó una asignatura de programación en el último año de carrera, pero sobre todo estudió el lenguaje R por su cuenta, ya que fue necesario para realizar su Trabajo Fin de Máster.
Le fue muy útil el libro
Robert Gentleman. (2008). R Programming for bioinformatics. Chapman and Hall.
¿Le ha ayudado a encontrar su trabajo actual?
No
¿Para qué usa R?
Javier López-Ibáñez ha desarrollado dos páginas web, las cuales utilizan programas en R para analizar datos que no serían los esperados por azar, además de realizar cálculos matemáticos.
La plataforma MBROLE se centra en programas para el estudio de metabolitos
http://csbg.cnb.csic.es/mbrole2/
La web BaFF sirve para caracterizar bacterias enriquecidas en un grupo con diferentes caracteres biológicos
En este caso R es muy útil para conseguir una distribución hipergeométrica. Dado un grupo de bacterias, se puede detectar si un conjunto de ellas (por ejemplo, las flageladas), aparece más por azar. (si se sobreexpresa un caracter)
https://academic.oup.com/bioinformatics/article-abstract/35/18/3482/5319939
¿Qué ventajas tiene R?
En R se ha desarrollado paquetes con funciones específicas muy útiles, de tal forma que puedes trabajar sobre ellos, sin necesidad de programar todo desde cero.
Comparándolo con Python, es un lenguaje muy específico.
¿Qué futuro le ve a R? ¿Es importante que los estudiantes de Biotecnología programen en este lenguaje?
Aunque este lenguaje ya experimentó un gran pico, cada vez los estudiantes salen más preparados en este lenguaje, por lo que va a mantenerse. Principalmente su función más importante es la de permitir distribuir distintas aplicaciones.
Borja Pitarch Jiménez
Graduado en Bioquímica (UCM) y estudiante del máster de Biotecnología industrial y ambiental (UCM)
¿Qué ha estudiado?
Tras realizar el grado de Bioquímica, está trabajando en su Trabajo Fin de Máster.
¿En qué trabaja actualmente?
Su TFM consiste en determinar la posición de distintos determinantes específicos, mediante el alineamiento de proteínas y el estudio de las interacciones entre ellas.
¿Por qué aprendió R?
Es una herramienta muy útil para su TFM y lo aprendió de forma autodidacta, con el libro mencionado anteriormente, Robert Gentleman. (2008). R Programming for bioinformatics. Chapman and Hall.
¿Le ha ayudado a encontrar su trabajo actual?
No, saber R no ha sido decisivo, pero trabaja constantemente con este lenguaje.
¿Para qué usa R?
En el desarrollo de su TFM lo utiliza para estudiar la interacción entre proteínas según sus determinantes antigénicos. R sirve para analizar datos estadísticos del alineamiento de dichas proteínas.
¿Qué ventajas tiene R?
Este lenguaje tiene multitud de bioconductos y librerías ya hechas, de gran importancia en el ámbito de la biología molecular. Además, son algoritmos muy específicos y la información necesaria para utilizarlos puede encontrarse de forma fácil. Destaca la cantidad de algoritmos ya creados en R y disponibles para la comunidad científica.
¿Qué futuro le ve a R? ¿Es importante que los estudiantes de Biotecnología programen en este lenguaje?
R tiene mucho potencial en el análisis y realización de datos en estadística.
Mónica de Mier Torrecilla
PhD en dinámica de fluidos computacional, CEO at Bytelab Solutions
¿Qué ha estudiado?
Graduada en Matemáticas, realizó el doctorado en dinámica computacional de fluidos. Además, ha cursado el Máster en Administración de Empresas (MBA) en ESADE Business School.
¿En qué trabaja actualmente?
Ha fundado una empresa de química computacional, llamada Bytelab Solutions. Esta empresa pretende extender el uso de las simulaciones químicas para el desarrollo de nuevos materiales, mediante un software de simulación para aplicaciones en el ámbito de la química muy específicas.
¿Por qué aprendió R?
Por su gran utilidad en el manejo de datos estadísticos.
¿Le ha ayudado a encontrar su trabajo actual?
No directamente, pero es una habilidad importante dentro del campo de Data sicience.
¿Para qué usa R?
En la empresa es utilizado para sacar patrones de datos experimentales.
Sin embargo, es realmente útil para el análisis estadístico en otros campos, como por ejemplo el baloncesto, que es su gran hobbie.
¿Qué ventajas tiene R?
R es un lenguaje muy bien pesado para estadística, y cabe destacar la gran cantidad de funciones que tiene.
¿Qué futuro le ve a R? ¿Es importante que los estudiantes de Biotecnología programen en este lenguaje?
Sí, el manejo de datos va a ser imprescindible en los próximos años y es fundamental que se estudien lenguajes de programación que permitan su estudio.
Aquilina de Mier Morante
Ingeniera de Montes
¿Qué ha estudiado?
Ha estudiado Ingeniería Forestal e Ingeniería de Montes
¿En qué trabaja actualmente?
Actualmente trabaja como ingeniera en protección forestal civil de Lombardía
¿Por qué aprendió R?
Aprendió en una de las asignaturas de la universidad y posteriormente lo utilizó para su Trabajo Fin de Carrera
¿Le ha ayudado a encontrar su trabajo actual?
No
¿Para qué usa R?
Su TFC consistió en el desarrollo de una fórmula para ajustar el volumen y el diámetro de cada árbol de especies diferentes para conseguir el mayor rendimiento de madera de una explotación.
¿Qué ventajas tiene R?
Destaca su flexibilidad para programar directamente en código. Además, las librerías disponibles permiten buscar la función que se necesita, sin tener que empezar desde cero.
¿Qué futuro le ve a R? ¿Es importante que los estudiantes de Biotecnología programen en este lenguaje?
Es importante saber al menos un lenguaje de programación, ya que son muy útiles en el desarrollo de nuevas soluciones y nuevos enfoques en prácticamente cualquier campo.